FAQs

Q1. 老师您好 我用pymol显示相互作用的时候 show sticks 然后蛋白的白塔折叠就断了 咋样显示让蛋白更好看一些不断裂呢?

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A1. 参见 入门教程中的 show 和 show as 的区别。

Q2. pymol里面打开结构很暗,重装软件也没有用,怎么解决?

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A2. OpenGL模块不兼容,在setting中rendering中设置关闭opengl,或者重新装opengl驱动。或者点击 File-> reinitialize->original settings.

Q3. 请问pymol如何消除自动补全的虚线啊?

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A3. 氨基酸缺失或者一段seq离开了自己原来的位置,pymol 会在它认为链接的地方加虚线。如果想要掩藏虚线,将其拆分成2个独立的object就可以了。

Q4. ray 渲染后内部非透明物体消失?

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Fig 1. befor ray

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Fig 2. after ray

可通过间接的方法实现ray后内部非透明物体可见,保留3张图片,然后1.openPOCKET; 2. closePocket; 3.proteintCartoon. 然后把3张图图片导入到PhotoShop中,从上到下一次是123的顺序就可以了。

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Fig 1. openPocket

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Fig 2. closePocket

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Fig 3. proteinCartoon

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Q5.